O atendimento é realizado a partir de uma abordagem biopsicossocial, considerando as necessidades clínicas, emocionais, sociais e funcionais de cada usuário. Para isso, o AME conta com uma equipe multiprofissional composta por profissionais das áreas de Psicologia, Serviço Social, Fisioterapia, Enfermagem, Nutrição e Medicina, com atuação em especialidades como Hematologia, Endocrinologia, Pediatria, Gastroenterologia Pediátrica e Pneumologia Pediátrica, entre outras.

O ambulatório também é referência no atendimento e acompanhamento de pessoas com Doenças Raras, por meio de encaminhamento via sistema de regulação, recebendo usuários de toda a região Centro-Oeste do Brasil. O serviço oferece atendimento multidisciplinar especializado, aconselhamento genético, orientação e apoio às famílias, além de ações voltadas à prevenção de complicações e sequelas, promoção da autonomia e integração social dos usuários.